Équipements financés ces dernières années

Créé en 2023 grâce au soutien du Canceropôle SUD, le réseau PETRA (recherche PrEclinique et TRAnslationnelle en neuro-oncologie) rassemble chercheurs, médecins, soignants, structures hospitalières et partenaires du monde socio-économique autour d’un objectif commun : accélérer le développement de nouvelles stratégies thérapeutiques pour améliorer la prise en charge des patients atteints de tumeurs cérébrales.

Le réseau s’appuie sur une approche intégrée « du patient au laboratoire, et du laboratoire au patient », favorisant un continuum entre recherche fondamentale, recherche préclinique et recherche clinique. Ses travaux concernent trois enjeux majeurs : les tumeurs cérébrales primitives de l’adulte et de l’enfant, les métastases cérébrales dont l’incidence ne cesse d’augmenter, et les complications neurologiques liées aux traitements anticancéreux.

Pour répondre à ces défis, le réseau PETRA a mis en place deux plateformes complémentaires

·        PETRATECH, qui met à disposition des modèles précliniques innovants (modèles cellulaires 3D, modèles animaux et radiothérapie préclinique de précision grâce au SARRP®) permettant de tester et d’optimiser de nouvelles approches thérapeutiques ;

·        PETRANSLA, qui facilite l’accès aux ressources biologiques et aux données cliniques annotées, tout en accompagnant les équipes vers la recherche clinique et les essais thérapeutiques. 

L’ARTC-Sud est un partenaire engagé du réseau PETRA depuis sa création. L’association a notamment contribué au financement du SARRP®, un équipement unique dans la Région Sud permettant de reproduire chez le petit animal des conditions d’irradiation très proches de celles utilisées chez les patients.

Aujourd’hui, ce partenariat se poursuit et se renforce : la Présidente de l’ARTC-Sud, Dominique Figarella-Branger, et la Vice-Présidente, Dominique David, siègent au Comité de Pilotage du réseau PETRA, où elles participent activement aux réflexions stratégiques et veillent à ce que la voix des patients reste au cœur des priorités du réseau.

Grâce à cette collaboration étroite entre chercheurs, cliniciens et représentants des patients, le réseau PETRA contribue à faire émerger les innovations thérapeutiques et à rapprocher la recherche des besoins concrets et des attentes des patients et de leurs familles.

Le microscope NIKON à fluorescence bénéficiant d'un financement ARTC SUD (15 keuros) a été installé au mois de juin 2023, dans le laboratoire du Pr JP Hugnot et Pr H Duffau, au sein du département de cancérologie de l'IGF (institut de génomique fonctionnelle) de Montpellier. Ce microscope permettra d'examiner les tumeurs de patients et à l'aide de traceurs fluorescent de mieux comprendre la composition des tumeurs en cellules tumorales et non tumorales. Le système à 3 fluorescences permet d'examiner 3 marqueurs tumoraux en même temps. Le microscope est aussi équipé d'une caméra d'une grande précision qui permet d'acquérir des images de très grande qualité. Le microscope sera notamment utilisé par les étudiants préparant un doctorat dans l'équipe, notamment ceux financés par l'ARTC SUD.

L’agitateur orbital résistant au CO₂ de Thermo Scientific™ a été installé en 2021 dans un incubateur pour le développement d’un nouveau modèle d’étude préclinique : le modèle tumoroïde (mini-tumeur in vitro). Cet appareil permet l’agitation lente et permanente nécessaire au maintien des tumoroïdes en culture que nous utiliserons pour le ciblage de nouvelles molécules thérapeutiques.

L’incubateur à CO₂ de Memmert installé en salle de culture en 2021 est un appareil indispensable à la culture cellulaire. Les cultures tumorales qui sont à la base de toutes nos expérimentations, sont maintenues dans cet incubateur où les taux de CO_2, d’O₂ et d’humidité sont contrôlés et constants. Cet incubateur a la particularité d’être compartimenté, permettant de limiter les ouvertures répétées et de ne pas perturber l’ensemble des cultures.

Acquis en 2018, le spectrophotomètre/fluoromètre DeNovix est utilisé pour effectuer une quantification rapide des acides nucléiques (ADN et ARN) et des protéines.

Cet appareil permet de doser du matériel génétique afin d’ensuite réaliser notamment des PCR.

Ce microscope à fluorescence Zeiss acheté 2017 est installé en une salle de culture. Il permet aux expérimentateurs de contrôler au quotidien l’état de leurs cultures cellulaires (cellules tumorales adhérentes, cellules souches tumorales en suspension, explants tumoraux et tumoroïdes). Certaines de ces cultures sont modifiées génétiquement et expriment des protéines fluorescences invisibles à l’œil nu, ce qui fait la nécessité de ce microscope. Cet appareil est également équipé d’une caméra reliée à l’ordinateur permettant aux expérimentateurs de prendre des photos de leurs expériences, par exemple pour mesurer l’efficacité d’une molécule sur la viabilité des cellules tumorales à différents temps.

Le MultiMACS Cell24 Separator Plus de Miltenyi est un séparateur de cellules semi-automatisé. L'instrument est conçu pour isoler pratiquement n'importe quel type de cellule de n'importe quelle source, donnant des résultats fiables et standardisés. Dans notre cas, nous l’utilisons pour isoler les différents types cellulaires présents dans les glioblastomes de patients : cellules endothéliales, cellules gliales, cellules immunitaires, cellules souches. La stérilité est maintenue par la hotte Heraguard de Thermo Scientific sous laquelle est disposée l’appareil. Nous pouvons ainsi remettre en culture ces cellules isolées et les analyser par la suite grâce à différentes expérimentations : prolifération, migration/invasion, étude de signalisation...

Elle nous permet de protéger nos échantillons afin de maintenir leur stérilité ainsi que celle des appareils présents en permanence sous cette hotte notamment le MultiMACS Cell24 Separator Plus de Miltenyi.

Il nous permet de travailler sur les prélèvements de glioblastome de patients ou sur les cellules isolées à partir de ces prélèvements et de maintenir leur stérilité durant leurs manipulations.

Elle nous permet de peser les prélèvements de glioblastome que nous recevons du bloc opératoire.

Le gentleMACS™ Octo Dissociator de Miltenyi est un appareil de paillasse destiné à la dissociation automatisée et standardisée de tous types de tissus, en suspensions cellulaires ou en lysats. Dans notre équipe, nous l’utilisons pour dissocier les glioblastomes provenant de patients en collaboration avec l’hôpital privé de Clairval à Marseille. Jusqu'à 8 échantillons peuvent être processés simultanément et de façon indépendante.

L’appareil Neon d’Invitrogen permet de réaliser très rapidement et de manière efficace des transfections qui se définissent comme le processus de transfert de gènes, c'est-à-dire l'introduction de matériel génétique (constructions de plasmides, siRNA…) ou de protéines, dans des cellules eucaryotes. Ceci permettra alors d’étudier la régulation et/ou les fonctions biologiques de ces gènes ou protéines candidats. Elle est typiquement réalisée par l'ouverture transitoire de pores dans les cellules pour permettre l'entrée de molécules extracellulaires qui seront alors exprimées par la cellule transfectée.